Identificación del potencial antidiabético de la Minthostachys Mollis (Muña) In Silico mediante la estimulación del GLP-1R por simulación de dinámica molecular
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Date
2025-03-04
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Publisher
Universidad Católica de Santa María
Abstract
Introducción: La Diabetes Mellitus Tipo 2 es una enfermedad muy prevalente a nivel
mundial, incluido el Perú, por lo que, es importante su diagnóstico y tratamiento. Entre
los diversos esquemas terapéuticos que existen, se ha comprobado que el agonismo de la
GLP-1R es eficaz. El GLP-1R es una proteína diana importante porque regula los niveles
de glucosa en sangre, mediante la cascada metabólica que una vez activada libera calcio
permitiendo que las células beta pancreáticas puedan producir insulina. Sin embargo, su
sustrato fisiológico, el GLP-1, es rápidamente degradado por la DPP-4 impidiendo la
activación del receptor y, consecuentemente, la cascada de reacciones. Por lo tanto, el
presente estudio, tuvo como objetivo analizar la interacción entre posibles agonistas,
como los fitoquímicos presentes en la Minthostachys mollis (Mentona, Carvacrol y
Timol), y el GLP-1R, demostrando su acción hipoglucemiante mediante un análisis
teórico-computacional.
Materiales y Métodos: Se realizó un estudio experimental in silico, en el que se obtuvo
la estructura GLP-1R a partir de la base de datos Protein Data Bank, y a los compuestos
moleculares: Timol, Carvacrol y Mentona de la base de datos PubChem. Dichas
estructuras fueron optimizadas para formar el sistema proteína-ligando, con el cual se
realizó la simulación de dinámica molecular utilizando el sofware GROMACS. Los
resultados se analizaron mediante las gráficas RMSD (Root Mean Square Deviation),
RMSF (Root Mean Square Fluctuation), radio de giro y Ramachandran. Finalmente, se
calculó la energía de interacción entre los componentes del sistema, ligando y proteína.
Resultados: La proteína GLP-1R fue estabilizada durante una simulación de 200 ns,
mientras que los complejos conformados por los ligandos: timol, carvacrol y mentona
fueron estabilizados a lo largo de una trayectoria de 100 ns en un sistema isocórico,
isotérmico e isobárico; logrando un equilibrio y evidenciando su afinidad de acuerdo con
el lugar de acoplamiento que se obtuvo y a la energía de interacción calculada.
Conclusión: Tras validar los modelos estructurales, la variación conformacional y la
energía generada por las interacciones moleculares entre los diferentes ligandos con el
GLP-1R, se determinó un alto potencial antidiabético del Timol y la Mentona
contribuyendo así al planteamiento de nuevos potenciales tratamientos para la DM2 con
el uso de recursos naturales.
Description
Keywords
Diabetes Mellitus tipo 2, Receptor del Péptido, Dinámica Molecular