Browsing by Author "Barazorda Ccahuana, Haruna Luz"

Now showing 1 - 3 of 3
  • Thumbnail Image
    Item
    Estudio de la permeabilidad de membranas biológicas a ésteres de ftalato y análisis de la formación de poros por métodos bioinformáticos y simulaciones computacionales: alcances en el efecto de los aditivos para plásticos
    (Universidad Católica de Santa María, 2023-06-15) Vilca Ccalli, Ninfa Maribel
    Los ftalatos son unas moléculas sintéticas de uso industrial que le confieren propiedades de plasticidad a los plásticos, estos están incluidos dentro de diversos productos de uso cotidiano como: cuidado personal, alimentos, medicamentos, material médico, entre otros. En el presente trabajo se estudió la permeabilidad de membranas biológicas y análisis de la formación de poros de tres compuestos de ésteres de ftalato (dimetil ftalato, ftatalo de dietilo y ftatalo de dibutilo) a diferentes concentraciones por estrategias de simulación computacional. Se aplicaron técnicas de análisis de propiedades ADMET, modelado estructural y simulaciones de dinámica molecular. Los resultados de la simulaciones demostraron que los ftalatos son compuestos que ingresan fácilmente a las membranas biológicas y las concentraciones altas logran formar agregados. Como resultado se obtuvo que el dietil ftalato ingresa en menor tiempo a la membrana seguido del dimetil ftalato y luego el dibutil ftalato. Donde, dietil ftalato atraviesa la membrana en el siguiente orden: 30 unidades, 15 unidades, 50 unidades, y 1 unidad. Con respecto al dimetil ftalato el orden fue el siguiente: 1 unidad, 15 unidades, 30 unidades, y 50 unidades, mientras que para el dibutil ftalato el orden fue el siguiente: 1 unidad, 15 unidades, 30 unidades, y 50 unidades. En conclusion, podemos ver que los monomeros de los diferentes ftalatos atraviesan facilmente la membrana durante el tiempo de 100 ns y logran formar agregados los monomeros que no tuvieron contacto con la membrana. Finalmente, esta investigación nos brinda un alcance sobre la permeabilidad de membranas biológicas a ésteres de ftalato, utilizando herramientas computacionales
  • Thumbnail Image
    Item
    Evaluación del Complejo Supramolecular Ureasa de Helicobacter Pylori a Diferentes PHS y la Acción de Nuevos Inhibidores: Un Enfoque Teórico Computacional en Ciencias Biomédicas
    (Universidad Católica de Santa María, 2019-04-17) Barazorda Ccahuana, Haruna Luz
    La infección por Helicobacter pylori es un problema de salud pública que afecta aproximadamente al 50% de la población mundial. Esta bacteria presenta diversos factores de patogenicidad, uno de los cuales es la ureasa, una proteína multimérica que cataliza la hidrólisis de la úrea a NH3 y CO2, lo que incrementa el pH del medio, permitiendo la supervivencia de H. pylori. La ureasa está conformada por dos subunidades y que componen un dodecámero altamente estable (( )3)4. El objetivo de este trabajo fue evaluar la estabilidad estructural de la ureasa a diferentes pHs y la búsqueda de nuevos inhibidores en base a un fármaco reportado en estudio clínico. Para ello se usaron técnicas de la física, química y biología computacional aplicada a modelos biológicos. Los resultaron nos mostraron que la ureasa es capaz de apoyar la supervivencia de H.pylori a condiciones de pHs bajos, debido a que posee 12 sitios catalíticos los cuales presentan dos iones de Ni+2 protegido por una solapa o flap que hace posible la apertura y cierre del sitio activo para el sustrato, susceptible a condiciones de pHs bajos. Además, se observó que a pH 2 existen más flaps abiertos que a pH 7. El análisis del acoplamiento receptor con ligando (úrea, ácido acetohidroxámico y cinco derivados del ácido acetohidroxámico) muestra que es necesario considerar al receptor con el flap abierto. La acetamida fue el derivado que presentó un acoplamiento similar a la úrea teniendo gran potencial para estudios futuros. En conclusión, se ha logrado comprender uno de los factores de supervivencia del H.pylori mediante la gran estabilidad de la ureasa a pHs bajos. Palabras clave: Helicobacter pylori, ureasa, pH, inhibidores, dinámica molecular.
  • Thumbnail Image
    Item
    Interacción de la Región Poliglutamínica de la Proteína Que Genera la Enfermedad de Huntington con Osmolitos Orgánicos, por Métodos de Bioinformática
    (Universidad Católica de Santa María, 2006-06-13) Barazorda Ccahuana, Haruna Luz
    Enfermedades Neurodegenerativas Enfermedades Neurodegenerativas por Repeticiones Inestables Enfermedad de Huntington Huntingtina Patogenicidad de la Huntingtina Mutada Neuropatología de la Enfermedad de Huntington Fisiopatología Síntomas Físicos y Psicológicos Tratamiento Incidencia de la Enfermedad de Huntington en El Mundo Terapia con Osmoprotectores Osmolitos Función de los Osmolitos Orgánicos Bioinformática Modelamiento Molecular Modelamiento Proteico Campos de Fuerza para Modelamiento Molecular Optimización Geométrica Dinámica Molecular Interacción Proteína-Ligando Validación de Estructuras Termodinámica Estadística Metodología y Detalles Computacionales Equipos y Software Análisis de la Estructura Primaria de la Proteína Huntingtina Construcción del Primer Exón de la Huntingtina Nativa Construcción del Primer Exón de la Huntingtina Mutada Construcción de los Osmolitos Orgánicos Formulación de Nuevos Campos de Fuerza Optimización de la Geometría Dinámica Molecular de Estructuras Terciarias Docking de Estructuras Terciarias Minimización y Dinámica Molecular de Estructuras Cuaternarias Validación de Estructuras Obtención y Estudio de Parámetros Termodinámicos