Determinación mediante MM/PBSA y virtual screening de potenciales agonistas y ortogonistas de la GLP-1R

Pinto Apaza, Uner Josseph

Determinación mediante MM/PBSA y virtual screening de potenciales agonistas y ortogonistas de la GLP-1R

dc.contributor.advisor	Gómez Valdez, Badhin
dc.contributor.author	Pinto Apaza, Uner Josseph
dc.date.accessioned	2025-01-07T17:39:15Z
dc.date.available	2025-01-07T17:39:15Z
dc.date.issued	2024-12-03
dc.description.abstract	El péptido 1 similar al Glucagón, una hormona incretina secretada por las células intestinales en respuesta a la ingesta de alimentos y que estimula la secreción de insulina en las células beta del páncreas, es un objetivo clave en la terapia de la diabetes. En este trabajo, se llevó a cabo un estudio in silico para evaluar la interacción de posibles compuestos de origen químico y natural con el receptor GLP-1, buscando candidatos con propiedades de ligandos. Se comenzó con el análisis detallado de la estructura del receptor GLP-1R tras una simulación de dinámica molecular de 100 ns, identificando múltiples sitios potenciales de interacción. Posteriormente, se realizó un cribado virtual (virtual screening) que permitió seleccionar compuestos prometedores tanto naturales como sintéticos. De estos, mediante criterios estocásticos, se eligieron los compuestos más estables y con mayor afinidad para avanzar en estudios más detallados. Dos estructuras cuaternarias fueron seleccionadas y sometidas a una dinámica molecular adicional de 100 ns en condiciones fisiológicas. Se evaluó la energía libre de enlace usando el método de mecánica molecular de área superficial de Poisson-Boltzmann (MM/PBSA), revelando que ambos compuestos tenían afinidad significativa por el sitio de unión predicho del receptor GLP-1. El compuesto de origen químico SID-22404666 mostró una energía libre de unión más favorable en comparación con el compuesto natural, además de presentar interacciones más estables con los residuos del receptor, sugiriendo un mayor potencial como análogo de GLP-1. Este estudio no solo subraya la capacidad de los enfoques de cribado virtual y simulación de dinámica molecular para identificar y optimizar nuevos agentes terapéuticos dirigidos al GLP-1R, sino que también proporciona una base sólida para el desarrollo de tratamientos más efectivos para la diabetes tipo 2. El análisis detallado de los sitios de interacción del receptor, junto con la simulación prolongada de las trayectorias moleculares, ha permitido identificar compuestos con alta afinidad y estabilidad, posicionando al SID-22404666 como un candidato particularmente prometedor para futuras investigaciones farmacéuticas.
dc.format	application/pdf
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12920/14506
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.publisher.country	PE
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	es_ES
dc.source	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.source	Repositorio de la Universidad Católica de Santa María - UCSM	es_ES
dc.subject	Dinámica molecular
dc.subject	Docking molecular
dc.title	Determinación mediante MM/PBSA y virtual screening de potenciales agonistas y ortogonistas de la GLP-1R
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
renati.advisor.dni	29705901
renati.advisor.orcid	0000-0001-6539-1207
renati.author.dni	77279087
renati.discipline	511316
renati.juror	Bernabe Ortiz, Julio Cesar
renati.juror	Barreda Del Carpio, Jaime Ernesto
renati.juror	Carpio Carpio, Jose Miguel
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/nivel#tituloProfesional
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
thesis.degree.discipline	Ingeniería Biotecnológica
thesis.degree.grantor	Universidad Católica de Santa María.Facultad de Ciencias Farmacéuticas, Bioquímicas y Biotecnológicas	es_ES
thesis.degree.name	Ingeniero Biotecnólogo