Análisis computacional de la estabilidad y afinidad de unión de inhibidores naturales y sintéticos sobre la proteína PARP-1 en la terapia del cáncer de mama triple negativo

Velasco Espezua, Rosangela

Análisis computacional de la estabilidad y afinidad de unión de inhibidores naturales y sintéticos sobre la proteína PARP-1 en la terapia del cáncer de mama triple negativo

dc.contributor.advisor	Manrique Sam Maria Cecilia
dc.contributor.author	Velasco Espezua, Rosangela
dc.date.accessioned	2026-03-26T20:22:25Z
dc.date.available	2026-03-26T20:22:25Z
dc.date.issued	2026-03-19
dc.description.abstract	El objetivo es evaluar la capacidad de compuestos naturales y sintéticos para inhibir la enzima PARP-1 mediante simulaciones moleculares, específicamente análisis de docking y dinámica molecular, para determinar su potencial como agentes terapéuticos para el cáncer de mama triple negativo (1)(6). En la metodología se seleccionaron cinco compuestos de origen natural y cinco sintéticos, cuyas estructuras se obtuvieron de bases de datos y se representaron en 2D. La estructura de PARP-1 se preparó mediante simulaciones de dinámica molecular en condiciones fisiológicas (pH, temperatura, presión) usando GROMACS con el force field OPLS-AA, alcanzando un equilibrio en 500 ns de trayectoria (4). Posteriormente, se realizó un proceso de solvatación y neutralización, seguido de simulaciones de 10 ns en NVT y presión en NPT. Para el docking, se empleó Autodock Vina, realizando 2000 repeticiones por ligando en condiciones ciegas, seleccionando la mejor interacción por energía de enlace (3)(4)(5). Los resultados mostraron que los compuestos sintéticos tienen una mayor afinidad por PARP- 1, con energías de interacción más negativas, en comparación con los compuestos naturales, que presentaron valores más ligeramente superiores. Las simulaciones de dinámica molecular confirmaron la estabilidad de los complejos, evidenciada en análisis de Ramachandran y parámetros estructurales como RMSD y radios de giro, que permanecieron estables durante las 100 ns. Se observó que, aunque los compuestos naturales tienen menor afinidad, aún inducen la inhibición de PARP-1, sugiriendo su potencial para promover apoptosis celular. El estudio concluye que los compuestos sintéticos muestran una mayor afinidad y estabilidad en la interacción con PARP-1, pero los compuestos naturales también presentan capacidad inhibitoria, aunque en menor grado. Esto indica que, en ausencia de compuestos sintéticos, los naturales pueden inhibir PARP-1 y promover apoptosis, lo cual es relevante para el desarrollo de nuevas terapias en el tratamiento del cáncer (1)(6). Además, los resultados respaldan la viabilidad de utilizar simulaciones computacionales para identificar potenciales inhibidores de PARP-1 de origen natural y sintético.
dc.format	application/pdf
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12920/16638
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.publisher.country	PE
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	es_ES
dc.source	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.source	Repositorio de la Universidad Católica de Santa María - UCSM	es_ES
dc.subject	Mecánica molecular
dc.subject	docking
dc.subject	dinámica molecular
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.02
dc.title	Análisis computacional de la estabilidad y afinidad de unión de inhibidores naturales y sintéticos sobre la proteína PARP-1 en la terapia del cáncer de mama triple negativo
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
renati.advisor.dni	29420612
renati.advisor.orcid	0000-0001-5229-0810
renati.author.dni	71731621
renati.discipline	912016
renati.juror	Del Castillo Solorzano, Noemi
renati.juror	Nuñez Zevallos, Gladys Edith
renati.juror	Salas Palma, Daniel Fernando
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
thesis.degree.discipline	Medicina Humana	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Católica de Santa María.Facultad de Medicina Humana	es_ES
thesis.degree.level	Título Profesional	es_ES
thesis.degree.name	Médico Cirujano