Caracterización de la naturaleza de interacción entre la proteína IL4I1 y sus inhibidores: un estudio integrado de reactividad química y dinámica molecular

Suni Curasi, Diego Leonardo; Vilca Quispe, Julissa

Caracterización de la naturaleza de interacción entre la proteína IL4I1 y sus inhibidores: un estudio integrado de reactividad química y dinámica molecular

dc.contributor.advisor	Gómez Valdez, Badhin
dc.contributor.author	Suni Curasi, Diego Leonardo
dc.contributor.author	Vilca Quispe, Julissa
dc.date.accessioned	2025-04-03T13:28:23Z
dc.date.available	2025-04-03T13:28:23Z
dc.date.issued	2025-03-14
dc.description.abstract	La IL4I1 se ha identificado como un actor clave en el entorno tumoral, debido a su rol en la activación del receptor AHR mediante metabolitos del triptófano, lo que suprime la respuesta antitumoral y favorece la progresión del cáncer. Este estudio evalúa la interacción entre IL4I1 y sus inhibidores derivados de fenilalanina, combinando análisis de reactividad electrónica, dinámica molecular y energías libres de unión. Para ello, se modelaron y optimizaron las geometrías de los ligandos mediante cálculos DFT (CAM-B3LYP, wB97XD y LC-wPBE con base TZVP) y se determinaron los índices de reactividad global y local. Seguidamente, se optimizó la estructura de IL4I1 en Gromacs (campo OPLS-AA) y se confirmó su estabilidad a través de análisis de RMSD, RMSF, radio de giro y diagramas de Ramachandran. Las simulaciones de dinámica molecular (ensamble NPT, 100 ns) y el análisis MM-PBSA revelaron diferencias significativas en la afinidad de unión, destacando que compuestos como Cp-07BIS, Cp-03, Cp-01, Cp-19 y Cp-16 presentan energías favorables (entre -80.6 y -77.4 kcal/mol). Además, los índices de reactividad evidencian que los compuestos más activos exhiben alta blandura y baja dureza, facilitando interacciones electrónicas, mientras que el análisis por residuo resalta la importancia de interacciones mediadas por residuos aromáticos y catiónicos (ARG-116, TRP-400, PHE-454 y PHE-238) en la estabilización de los complejos, posicionando las subcavidades P-1 y P-2 como zonas críticas para la unión. En conjunto, estos hallazgos logran caracterizar y profundizar en el conocimiento de la naturaleza de interacción de IL4I1 y sus inhibidores
dc.format	application/pdf
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12920/14932
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.publisher.country	PE
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	es_ES
dc.source	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.source	Repositorio de la Universidad Católica de Santa María - UCSM	es_ES
dc.subject	PBSA
dc.subject	IL4I1
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
dc.title	Caracterización de la naturaleza de interacción entre la proteína IL4I1 y sus inhibidores: un estudio integrado de reactividad química y dinámica molecular
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
renati.advisor.dni	29705901
renati.advisor.orcid	0000-0001-6539-1207
renati.author.dni	70343114
renati.author.dni	72693040
renati.discipline	511316
renati.juror	Barreda Del Carpio, Jaime Ernesto
renati.juror	Paredes Fuentes, Julitza Lindsey
renati.juror	Barazorda Ccahuana, Haruna Luz
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
thesis.degree.discipline	Ingeniería Biotecnológica
thesis.degree.grantor	Universidad Católica de Santa María.Facultad de Ciencias Farmacéuticas, Bioquímicas y Biotecnológicas	es_ES
thesis.degree.name	Ingeniero Biotecnólogo