Desarrollo y validación de la prueba molecular de qPCR para la detección de los genes blaTEM y blaCTX-M en aguas residuales de la Planta de Tratamiento del Fundo La Banda en Huasacache - Arequipa

Zegarra Banda, Ariana Camila

Desarrollo y validación de la prueba molecular de qPCR para la detección de los genes blaTEM y blaCTX-M en aguas residuales de la Planta de Tratamiento del Fundo La Banda en Huasacache - Arequipa

dc.contributor.advisor	Carpio Carpio, José Miguel
dc.contributor.author	Zegarra Banda, Ariana Camila
dc.date.accessioned	2026-06-16T14:05:52Z
dc.date.available	2026-06-16T14:05:52Z
dc.date.embargoEnd	2027-05-26
dc.date.issued	2026-05-26
dc.description.abstract	La resistencia antimicrobiana es un problema de salud pública que afecta de manera silenciosa a la población, las aguas residuales son uno de los principales reservorios de genes de resistencia y es necesario contar con medidas adecuadas para eliminar estos genes, el objetivo de este estudio fue desarrollar y validar la prueba molecular de qPCR para detectar los genes de resistencia blaTEM y blaCTX-M en aguas residuales de la planta de tratamiento del Fundo La Banda en Huasacache - Arequipa. Para esto se tomaron 24 muestras del afluente de la PTAR durante 2 meses, las cuales se concentraron con un sistema de filtración, luego se extrajo el ADN bacteriano empleando un kit de extracción por columna, para amplificarlo por la técnica de qPCR que se optimizó; además se realizó secuenciación Shotgun de las muestras y su respectivo análisis bioinformático. Se obtuvo un límite de detección (LOD) de 1.765 pg/μL para ambos genes de resistencia. En la validación analítica se obtuvo un R2 de 0.9946 y 0.9936 con una eficiencia de 96.86% y 90.73% para blaTEM y blaCTX-M, respectivamente. Se detectó para qPCR un porcentaje de positividad de 100% y 27.27% para los genes blaTEM y blaCTX-M, respectivamente y en el caso de secuenciación del 86.36% y 9.09%, respectivamente; qPCR para el gen blaTEM tuvo una especificidad del 100%, un valor predictivo positivo (VPP) de 86% y una exactitud diagnóstica del 86%, y el gen blaCTX-M presentó una sensibilidad del 60%, un valor predictivo negativo (VPN) de 82%, una exactitud diagnóstica del 53% y un coeficiente de Kappa de -0.21. Se desarrolló y validó dos protocolos de qPCR altamente sensible para la detección de los genes blaTEM y blaCTX-M, además, se pudo evaluar estos nuevos protocolos con el secuenciamiento Shotgun.
dc.format	application/pdf
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12920/17043
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.publisher.country	PE
dc.rights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	es_ES
dc.source	Universidad Católica de Santa María	es_ES
dc.source	Repositorio de la Universidad Católica de Santa María - UCSM	es_ES
dc.subject	Aguas residuales
dc.subject	Genes blaTEM y blaCTX-M
dc.subject	PCR en tiempo real.
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#2.08.00
dc.title	Desarrollo y validación de la prueba molecular de qPCR para la detección de los genes blaTEM y blaCTX-M en aguas residuales de la Planta de Tratamiento del Fundo La Banda en Huasacache - Arequipa
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
renati.advisor.dni	42671615
renati.advisor.orcid	0000-0003-4326-528X
renati.author.dni	73145961
renati.discipline	511316
renati.juror	Barazorda Ccahuana, Haruna Luz
renati.juror	Ita Balta, Yuma Aracely
renati.juror	Johnson Corrales, Fabrizio
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
thesis.degree.discipline	Ingeniería Biotecnológica
thesis.degree.grantor	Universidad Católica de Santa María.Facultad de Ciencias Farmacéuticas, Bioquímicas y Biotecnológicas	es_ES
thesis.degree.name	Ingeniera Biotecnóloga