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Desarrollo y validación de la prueba molecular de qPCR para la detección de los genes blaTEM y blaCTX-M en aguas residuales de la Planta de Tratamiento del Fundo La Banda en Huasacache - Arequipa
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Fecha
2026-05-26
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Editor
Universidad Católica de Santa María
Nivel de acceso
Acceso Embargado
Resumen
La resistencia antimicrobiana es un problema de salud pública que afecta de manera silenciosa a la población, las aguas residuales son uno de los principales reservorios de genes de resistencia y es necesario contar con medidas adecuadas para eliminar estos genes, el objetivo de este estudio fue desarrollar y validar la prueba molecular de qPCR para detectar los genes de resistencia blaTEM y blaCTX-M en aguas residuales de la planta de tratamiento del Fundo La Banda en Huasacache - Arequipa. Para esto se tomaron 24 muestras del afluente de la PTAR durante 2 meses, las cuales se concentraron con un sistema de filtración, luego se extrajo el ADN bacteriano empleando un kit de extracción por columna, para amplificarlo por la técnica de qPCR que se optimizó; además se realizó secuenciación Shotgun de las muestras y su respectivo análisis bioinformático. Se obtuvo un límite de detección (LOD) de 1.765 pg/μL para ambos genes de resistencia. En la validación analítica se obtuvo un R2 de 0.9946 y 0.9936 con una eficiencia de 96.86% y 90.73% para blaTEM y blaCTX-M, respectivamente. Se detectó para qPCR un porcentaje de positividad de 100% y 27.27% para los genes blaTEM y blaCTX-M, respectivamente y en el caso de secuenciación del 86.36% y 9.09%, respectivamente; qPCR para el gen blaTEM tuvo una especificidad del 100%, un valor predictivo positivo (VPP) de 86% y una exactitud diagnóstica del 86%, y el gen blaCTX-M presentó una sensibilidad del 60%, un valor predictivo negativo (VPN) de 82%, una exactitud diagnóstica del 53% y un coeficiente de Kappa de -0.21. Se desarrolló y validó dos protocolos de qPCR altamente sensible para la detección de los genes blaTEM y blaCTX-M, además, se pudo evaluar estos nuevos protocolos
con el secuenciamiento Shotgun.
Descripción
Palabras clave
Aguas residuales, Genes blaTEM y blaCTX-M, PCR en tiempo real.