Evaluación in Silico del efecto del CU++ sobre el complejo enzimático del Tripanotión del Tripanosoma Cruzi orientado a nuevos métodos de diagnóstico
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Date
2021-05-28
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Publisher
Universidad Católica de Santa María
Abstract
Introducción. La Enfermedad de Chagas es un problema de salud pública desatendido en
nuestro país y de gran incidencia en la región de Arequipa. La falta de herramientas de screening
masivo es una de las limitaciones para hacer detecciones tempranas de la infección por T. cruzi.
El objetivo del estudio fue describir las interacciones moleculares de iones de cobre con la
enzima tripanotión reductasa y su sustrato.
Materiales y Métodos. Se utilizó la estructura del tripanotión reductasa (PDB: 1BZL); con su
respectivo cofactor FAD y su ligando tripanotión. Se hicieron las modificaciones del tripanotión
añadiendo cobre a los grupos tioles. Se emplearon técnicas de dinámica molecular utilizando el
software Gromacs 2019.2 para las simulaciones. Los servidores utilizados fueron PockDrug y
Patchdock para identificar los pockets y realizar el acoplamiento molecular, respectivamente.
Resultados. La simulación del tripanotión reductasa mantuvo los parámetros estables luego de
los 100ns, reflejados en los valores obtenidos en el RMSD, RMSF, Radio de Giro y enlaces de
hidógeno. Se encontraron 2 bolsillos en la proteína con valores de drugabilidad de 97%; estos
valores están vinculados a la acción del ligando FAD y del sustrato-tripanotión. El acoplamiento
entre el tripanotión modificado y la proteína nos mostró valores de energía de contacto atómica
de -215.88 Kcal/mol (cadena A) y -201.65 Kcal/mol (cadena B) y la interacción con el
tripanotión modificado con Cobre fue de -219.60 Kcal / mol.
Conclusión. Los comportamientos energéticos y estructurales del tripanotión modificado y
nativo son similares; los que nos permiten considerarlo como un objetivo para el desarrollo de
potencial herramientas de diagnóstico masivo.
Description
Keywords
Trypanosoma cruzi, Simulaciones de dinámica molecular, Cobre, Diagnóstico temprano, Tripanotión reductasa