Determinación mediante simulación de dinámica molecular, de la influencia de la temperatura en la polcalcina PHL P 7 presente en maíz ( Zea mays) respecto a su forma aislada e interctuante con la IGE
| dc.contributor.advisor | Gómez Valdez, Badhin | |
| dc.contributor.author | Ayqui Cueva, Flor Avelina | |
| dc.date.accessioned | 2022-05-06T15:37:14Z | |
| dc.date.available | 2022-05-06T15:37:14Z | |
| dc.date.issued | 2022-03-31 | |
| dc.description.abstract | La proteína Phl p 7 es una de las polcalcinas mejor caracterizadas con respecto a la reactividad cruzada entre la IgE y su estructura tridimensional, ya que posee la mayor cantidad de epítopos. En el presente trabajo se ha hecho un estudio in silico investigando las diferentes interacciones de unión entre la Phl p 7 de Zea Mays sometida a diferentes temperaturas (17 °C, 37 °C, 57.9 °C, 77.3 °C y 97.3 °C) y un fragmento de unión a antí- geno (Fab) adoptando dinámica molecular (DM). Con el objetivo de dilucidar los detalles moleculares de esta polcalcina se realizaron diferentes DM a 500 ns únicamente de la Phl p 7 a las diferentes temperaturas mencionadas anteriormente. Después se procedió a hacer una acoplamiento molecular entre las estructuras resultantes de la Phl p 7 después de las DM y la región Fab. Obteniendo como resultado 10 diferentes estructuras cuaternarias, basados en datos como la energía global, área de interfaz y penetración de la Phl p 7 dentro del sitio de complementariedad (CDR). A continuación, se realizaron diferentes DM de 100 ns para estas 10 diferentes estructuras cuaternarias a condiciones fisiológicas (37 °C y 1 bar). La energía libre de enlace se evaluó con la mecánica molecular de área superficial de Poisson-Boltzmann (MM/PBSA). Se utilizó este método para evaluar la variación de la afinidad de la Phl p 7 después de haber sido sometida a diferentes tem- peraturas. Nuestros resultados muestran que a pesar de haber sometido a la polcalcina a altas temperatura como a 77.3 °C presentó varias características óptimas para que se de una reacción espontanea de unión entre la Phl p 7 y el CDR. También sucedió esto con la estructura de la Phl p 7 después de someterla a 17 °C. Los resultados muestran que la Phl p 7 presenta una alta termoestabilidad y una estructura con varios epítopos, lo que conlleva a que se de una gran probabilidad de desencadenar una alergia mediada por IgE. | es_ES |
| dc.description.uri | Tesis | es_ES |
| dc.format | application/pdf | es_ES |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ucsm.edu.pe/handle/20.500.12920/11602 | |
| dc.language.iso | spa | es_ES |
| dc.publisher | Universidad Católica de Santa María | es_ES |
| dc.publisher.country | PE | es_ES |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | es_ES |
| dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | es_ES |
| dc.source | Universidad Católica de Santa María | es_ES |
| dc.source | Repositorio de la Universidad Católica de Santa María - UCSM | es_ES |
| dc.subject | Polcalcina | es_ES |
| dc.subject | Inmunoglobulina E | es_ES |
| dc.subject | Temperatura | es_ES |
| dc.subject | Dinámica Molecular | es_ES |
| dc.subject.ocde | https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03 | es_ES |
| dc.title | Determinación mediante simulación de dinámica molecular, de la influencia de la temperatura en la polcalcina PHL P 7 presente en maíz ( Zea mays) respecto a su forma aislada e interctuante con la IGE | es_ES |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis | es_ES |
| dc.type.version | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | es_ES |
| renati.advisor.dni | 29705901 | |
| renati.advisor.orcid | 0000-0001-6539-1207 | es_ES |
| renati.author.dni | 71331474 | |
| renati.discipline | 511316 | es_ES |
| renati.juror | Cardenas Garcia, Jaime Dante | es_ES |
| renati.juror | Barreda Del Carpio, Jaime Ernesto | es_ES |
| renati.juror | Carpio Carpio, José Miguel | es_ES |
| renati.level | https://purl.org/pe-repo/renati/nivel#tituloProfesional | es_ES |
| renati.type | https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis | es_ES |
| thesis.degree.discipline | Ingeniería Biotecnológica | es_ES |
| thesis.degree.grantor | Universidad Católica de Santa María.Facultad de Ciencias Farmacéuticas, Bioquímicas y Biotecnológicas | es_ES |
| thesis.degree.level | Título Profesional | es_ES |
| thesis.degree.name | Ingeniera Biotecnóloga | es_ES |