Diseño y Construcción de la Estructura Completa del Receptor de Insulina Humana Mediante Métodos Computacionales
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Date
2024-12-05
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Publisher
Universidad Católica de Santa María
Abstract
El receptor de insulina (IR) humana pertenece a la familia de los receptores tirosina
quinasas, siendo la Isoforma B de este receptor la más abundante en los tejidos periféricos
y la que presenta mayor afinidad por la insulina. Esto último hace que dicha
isoforma se encuentre más involucrada en los efectos metabólicos. Por lo que el objetivo
del presente trabajo de investigación fue diseñar y construir la estructura completa del
receptor de insulina Isoforma B mediante el uso de métodos computacionales, considerando
que estos últimos contribuyen al desarrollo de estructuras viables cuando los
métodos experimentales no son suficientes. Esto ha sido observado con el IR, principalmente,
pero no limitado a, su segmento transmembrana y juxtamembrana, los cuales
presentan fragmentos de su secuencia sin estructura predicha. Es así que, este estudio
se ha realizado de forma teórica utilizando servidores basados en métodos de predicción
por comparación y ab initio para obtener los fragmentos faltantes de su estructura. El
dímero completo del receptor se ensambló mediante el uso de los visualizadores Chimera
y Pymol, y la adición de N-glicanos al mismo se realizó con doGlycans. La dinámica
para la optimización de la estructura final se realizó con Gromacs 2019.2 durante 100
ns usando una temperatura de 36.5°C y 1 bar de presión. Finalmente, el uso de diferentes
métodos para la evaluación de la estructura permitió concluir que se requiere de
un mayor tiempo de dinámica molecular para confirmar que la estructura se encuentra
en su estado nativo. No obstante, la estructura obtenida en formato .pdb puede ser
utilizada para futuras dinámicas.
Description
Keywords
Dinámica molecular, Estructura, Insulina