Diseño y Construcción de la Estructura Completa del Receptor de Insulina Humana Mediante Métodos Computacionales

Loading...
Thumbnail Image

Date

2024-12-05

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Universidad Católica de Santa María

Abstract

El receptor de insulina (IR) humana pertenece a la familia de los receptores tirosina quinasas, siendo la Isoforma B de este receptor la más abundante en los tejidos periféricos y la que presenta mayor afinidad por la insulina. Esto último hace que dicha isoforma se encuentre más involucrada en los efectos metabólicos. Por lo que el objetivo del presente trabajo de investigación fue diseñar y construir la estructura completa del receptor de insulina Isoforma B mediante el uso de métodos computacionales, considerando que estos últimos contribuyen al desarrollo de estructuras viables cuando los métodos experimentales no son suficientes. Esto ha sido observado con el IR, principalmente, pero no limitado a, su segmento transmembrana y juxtamembrana, los cuales presentan fragmentos de su secuencia sin estructura predicha. Es así que, este estudio se ha realizado de forma teórica utilizando servidores basados en métodos de predicción por comparación y ab initio para obtener los fragmentos faltantes de su estructura. El dímero completo del receptor se ensambló mediante el uso de los visualizadores Chimera y Pymol, y la adición de N-glicanos al mismo se realizó con doGlycans. La dinámica para la optimización de la estructura final se realizó con Gromacs 2019.2 durante 100 ns usando una temperatura de 36.5°C y 1 bar de presión. Finalmente, el uso de diferentes métodos para la evaluación de la estructura permitió concluir que se requiere de un mayor tiempo de dinámica molecular para confirmar que la estructura se encuentra en su estado nativo. No obstante, la estructura obtenida en formato .pdb puede ser utilizada para futuras dinámicas.

Description

Keywords

Dinámica molecular, Estructura, Insulina

Citation