Análisis por simulación de dinámica molecular de la inhibición de la enzima topoisomerasa 1 humana (TOP1) por metabolitos presentes en la pulpa de Annona cherimola
Date
2024-09-03
Authors
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Publisher
Universidad Católica de Santa María
Abstract
La familia Annonaceae comprende 108 géneros y más de 2400 especies; esta familia parece
haberse originado en los Andes Americanos en Perú y Ecuador, sin embargo, se reconocen
especies de esta familia en diferentes zonas tropicales de Africa y Asia. Las especies del
género Annona se usan en la medicina tradicional para el tratamiento de diversas
enfermedades, estas especies muestran un abanico de compuestos bioactivos que incluyen
acetogeninas, flavonoides, alcaloides, esteroides y péptidos; mientras que diversos estudios
han probado que este género presenta actividad biológica como: antitumoral, antioxidante,
antimicrobiana y antifúngica. Annona cherimola, conocida tradicionalmente como
chirimoya, es una fruta exótica de este género consumida en Sudamérica. La actividad antitopoisomerasa
del extracto de pulpa de esta fruta se asocia con presencia de cuatro
diterpenoides de la familia de los kauranos: ácido gumiferólico (GUM), isopimara-7,15-
dien-3-ona (ISO), kauran-15-ol (K15) y kauran-16-ol (K16). Debido a que la topoisomerasa
1 humana (TOP1) es un blanco terapéutico para quimioterapia, es importante conocer el
mecanismo de inhibición de esta enzima por parte de estos compuestos. Para este fin se
utilizaron herramientas bioinformáticas para generar modelos moleculares de TOP1, GUM,
ISO, K15 y K16. Estos modelos fueron sometidos a simulación de dinámica molecular (MD)
y mecánica molecular (MM) para prepararlos para el docking molecular correspondiente.
Los complejos generados fueron sometidos a simulación MD y analizados mediante
GROMACS, LigPlot+ y el método MM-PBSA. El complejo GUM-1EJ9 mostró la mayor
energía de interacción, así como la mayor constante de inhibición, además de interacciones
con aminoácidos del centro activo de la enzima, por lo que GUM podría actuar como un
inhibidor competitivo de la enzima TOP1
Description
Keywords
Annona cherimola, Human topoisomerase, Ácido gumiferólico