Maestría en Bioquímica y Biología Molecular

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Examinando Maestría en Bioquímica y Biología Molecular por Materia "CARD"

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    Identificación metagenómica de genes resistentes a antibióticos en bacterias de la bahía interior de Puno y Captación Chimu - Puno 2023
    (Universidad Católica de Santa María, 2025-08-26) Coaquira Adco, Nilda
    El presente estudio tuvo como objetivo identificar la presencia de ARG en metagenomas de consorcios bacterianos de la Bahía Interior y Captación Chimu del Lago Titicaca mediante secuenciación metagenómica shotgun, un método que permite fragmentar el ADN en segmentos de diferentes tamaños, secuenciarlo masivamente y ensamblarlo computacionalmente para la reconstrucción del genoma completo. La calidad de las secuencias fue evaluada a través de la plataforma Galaxy, y el ensamblaje de los genes se realizó con el programa MEGAHIT, utilizando la base de datos CARD para la identificación de ARG en las muestras analizadas. Los resultados obtenidos reportan que en la Bahía Interior los genes con mayor cobertura fueron vanYB (30.08%), asociado a resistencia a glicopéptidos como la vancomicina en Enterococcus faecium; dfrB1 (8.86%), relacionado con resistencia a trimetoprima en Escherichia coli; catV (7.27%), que confiere resistencia a cloranfenicol en Brevibacillus brevis; y Ecol_emrE (6.31%), involucrado en la resistencia a fluoroquinolonas en E. coli, mientras que en la Captación Chimu los ARG con mayor cobertura fueron vanYB (42.75%), vanWI (20.59%), asociado a resistencia a vancomicina en Enterococcus faecalis; evgA (4.39%), que regula bombas de eflujo responsables de la resistencia a β-lactámicos en E. coli; y OXA-726, vinculada a resistencia a carbapenémicos en Acinetobacter baumannii. En total, se identificaron 28 ARG en la Bahía Interior y 35 ARG en la Captación Chimu, concluyéndose que vanYB es el ARG con mayor cobertura en ambas zonas, y que los genes dfrB1, catV, vanWI y evgA son los más representativos, lo que resalta la necesidad de implementar estrategias de monitoreo y control para mitigar la propagación de la resistencia antimicrobiana en el Lago Titicaca.