Figueroa Banda, Rufo AlbertoGutierrez Gomez, Erika Magally2026-06-162026-06-162026-05-26https://hdl.handle.net/20.500.12920/17066Objetivo: Comparar la composición y diversidad del microbioma subgingival entre pacientes con periodontitis y personas con salud periodontal, mediante análisis computacional de secuencias 16S rRNA y anotación taxonómica basada en la Human Oral Microbiome Database (HOMD/eHOMD). Métodos: Se realizó un estudio observacional, retrospectivo, transversal, descriptivo-comparativo de tipo in silico sobre un conjunto de 85 muestras subgingivales (45 con salud periodontal y 40 con periodontitis). Las abundancias de 26 géneros bacterianos, mapeados a la taxonomía e HOMD V16.03 (820 taxones HMT únicos), fueron analizadas en Python 3.10 (SciPy, scikit-learn). La diversidad alfa se cuantificó mediante los índices de Shannon, Simpson (1-D) y riqueza observada, y fue comparada entre grupos con la prueba U de Mann-Whitney. La diversidad beta se evaluó mediante distancia de Bray-Curtis, ordenación por Análisis de Coordenadas Principales (PCoA) y PERMANOVA (999 permutaciones). La abundancia diferencial se evaluó con la prueba U de Mann-Whitney con corrección por tasa de descubrimiento falso (FDR) de Benjamini-Hochberg. Se construyó un clasificador Random Forest con validación cruzada 10-fold estratificada para identificar firmas microbianas discriminantes. Resultados: La diversidad alfa resultó significativamente mayor en el grupo Periodontitis (Shannon 2,750 ± 0,130) que en el grupo Salud (Shannon 2,547 ± 0,161; p = 4,23×10-⁸; r = 0,692). El PERMANOVA reveló una separación clara entre grupos (Pseudo-F = 43,47; R² = 0,344; p = 0,001), con el eje PCoA1 explicando el 32,1 % de la varianza. Veinticinco de los 26 géneros evaluados mostraron abundancia diferencial significativa (FDR < 0,05): 13 enriquecidos en periodontitis y 12 en salud. Los géneros con mayor enriquecimiento en periodontitis incluyeron Desulfobulbus (log2FC = 4,51), Fretibacterium (log2FC = 3,55), Tannerella (log2FC = 3,21) y Porphyromonas (log2FC = 3,07); mientras que Streptococcus, Corynebacterium, Actinomyces y Gemella dominaron en salud.application/pdfspainfo:eu-repo/semantics/openAccessMicrobioma subgingivalPeriodontitisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01